Uno dei trattamenti di base e allo stesso tempo difficili per la cura durante lo svernamento è il mantenimento del corretto contenuto di umidità del supporto. L'intensità delle annaffiature è influenzata da diversi fattori, come la perdita di foglie da parte delle piante per l'inverno, la temperatura di conservazione, il tipo di substrato e, infine, le esigenze delle singole specie.Le piante che perdono le foglie per l'inverno, come datura, fucsia e gerani, vengono annaffiate moderatamente per evitare che la zolla si secchi.
Le piante che sono sempre verdi traspirano ancora, quindi vengono annaffiate più abbondantemente. Va però ricordato che le piante, rimanendo a temperature relativamente basse, attraversano un periodo di dormienza, in cui tutti i loro processi fisiologici sono più lenti, per cui non necessitano di tanta acqua come durante lo sviluppo intensivo in estate. L'acqua stagnante non solo limita l'accesso dell'ossigeno alle radici, facendole marcire, ma nelle condizioni fresche del giardino d'inverno contribuisce rapidamente anche alle infezioni fungine.
Per evitare che ciò accada, piantare le piante in un substrato ben drenato e fornire loro uno spesso strato di drenaggio. L'argilla e i substrati organici come la torba hanno un'elevata capacità di ritenzione idrica. Tali superfici devono essere allentate, ad esempio con sabbia.